O Instituto Superior Politécnico de Gaza é dirigido por um Director-Geral, coadjuvado por dois Directores-Gerais Adjuntos.

Compete ao Director -Geral para além das competências atribuídas nos termos do artigo 11 da Resolução nº 25/2010, de 07 de Outubro, aplicar as normas constantes do Estatuto Geral dos Funcionários e Agentes do Estado, bem como de outros diplomas legais.

Em caso de impedimento, o Director -Geral é substituído por um Director-Geral Adjunto segundo o estabelecido no seu estatuto orgânico.